Vraag 16b: Regressiecoëfficënt hoofdeffect histologische klasse (leesopdracht)

De regressiecoëfficiënt $β_{g 3}$ kwantificeert het verschil in log2-getransformeerd geometrische gemiddelde ook de log2 fold change genoemd van de genexpressie bij patiënten van histologische klasse 1 ( $x_{g 3} = 0$ ) en histologische klasse 3 ( $x_{g 3} = 1$ ) met onaangetaste lymfeklieren ( $x_{n 1} = 0$ ). Ter illustratie (en deze manier van werken kan je op analoge manier toepassen op de andere regressiecoëfficiënten):

Log2 getransformeerd geometrisch gemiddelde genexpressie bij patiënten van histologische klasse 1 met onaangetaste lymfeklieren

μ_{1} = E [Y | x_{g 3} = 0, x_{n 1} = 0] = β_{0} + β_{g 3} \cdot 0 + β_{n 1} \cdot 0 + β_{g 3 n 1} \cdot 0 \cdot 0 = β_{0}

Log2 getransformeerd geometrisch gemiddelde genexpressie bij patiënten van histologische klasse 3 met onaangetaste lymfeklieren

μ_{2} = E [Y | x_{g 3} = 1, x_{n 1} = 0] = β_{0} + β_{g 3} \cdot 1 + β_{n 1} \cdot 0 + β_{g 3 n 1} \cdot 0 \cdot 0 = β_{0} + β_{g 3}

Verschil in log2 getransformeerd geometrisch gemiddelde genexpressie bij patiënten van histologische klasse 1 en histologische klasse 3 met onaangetaste lymfeklieren of ook wel de log2 Fold Change in KPNA2 expressie tussen patiënten van histologische klasse 1 en histologische klasse 3 met onaangetaste lymfeklieren

μ_{2} - μ_{1} = (β_{0} + β_{g 3}) - β_{0} = β_{g 3}

Het verschil in log2 geometrisch gemiddelde genexpressie/log2 fold change tussen deze twee groepen patiënten wordt dus precies gegeven door de regressiecoëfficiënt $β_{g 3}$ .