Eerst visualizeren we de associatie tussen concentration en enzyme rate, voor beide enzyme states.
Maak een plot voor iedere enzyme state (met facet_wrap) waarin we alle datapunten kunnen zien. Fit een rode kromme lijn en zwarte kromme lijn door de punten. Sla deze figuur op in assocation_plot1
In de plot kunnen we zien dat er een relatie is tussen rate en concentration, deze relatie ziet er wel niet lineair uit.
Om de impact van een log transformatie van concentratie na te gaan maken we een nieuwe kolom log10conc
aan in Puromycin
. Omdat de concentratie gemeten is in ppm zullen we een log10 transformatie gebruiken.
Plot de vorige figuur nogmaals maar met de log10conc
variabele. Sla deze figuur op in assocation_plot2
.
De relatie ziet er nu wel lineair uit.