De output uit de vorige vraag laat zien dat er een zeer significante interactie is. Het effect van de histologische classificatie op de genexpressie verschilt dus afhankelijk van de status van de lymfeknoop en vice versa.
De onderzoekers zijn daarom geïnteresseerd in het bestuderen en rapporteren van de volgende vijf onderzoekshypothesen:
Is het geometrisch gemiddelde van de KPNA2-expressie verschillend tussen klasse 3- en klasse 1-tumoren in patiënten met niet-aangetaste lymfeklieren (node = 0)?
-> testen van \(H_0: \log_2{FC}_{g3n0-g1n0}=0\text{ vs. }H1: \log_2{FC}_{g3n0-g1n0}\neq 0\)
Is het geometrisch gemiddelde van de KPNA2-expressie verschillend tussen klasse 3- en klasse 1-tumoren in patiënten met verwijderde lymfeklieren (node = 1)?
-> testen van \(H_0: \log_2{FC}_{g3n1-g1n1}=0\text{ vs. }H1: \log_2{FC}_{g3n1-g1n1}\neq 0\)
Is het geometrisch gemiddelde van de KPNA2-expressie verschillend in klasse 1-tumoren (grade = 1) tussen patiënten met verwijderde en patiënten met niet-aangetaste lymfeklieren?
-> testen van \(H_0: \log_2{FC}_{g1n1-g1n0}=0\text{ vs. }H1: \log_2{FC}_{g1n1-g1n0}\neq 0\)
Is het geometrisch gemiddelde van de KPNA2-expressie verschillend in klasse 3-tumoren (grade = 3) tussen patiënten met verwijderde en patiënten met niet-aangetaste lymfeklieren?
-> testen van \(H_0: \log_2{FC}_{g3n1-g3n0}=0\text{ vs. }H1: \log_2{FC}_{g3n1-g3n0}\neq 0\)
Is de fold change van het KPNA2-gen tussen klasse 3 en klasse 1 afhankelijk van de lymfeklierstatus en omgekeerd?
-> reeds getest door de interactie te beoordelen: \(H_0: \log_2{FC}_{g3n0-g1n0}=\log_2{FC}_{g3n1-g1n1} \text{ vs. }H1:\log_2{FC}_{g3n0-g1n0}\neq\log_2{FC}_{g3n1-g1n1}\)